Il progetto BiodiverSO ha contribuito a sequenziare Il genoma cloroplastico del Carciofo brindisino.
Il genoma cloroplastico di questa importante varietà locale di carciofo (Cynara cardunculus var. scolymus), che è stato sequenziato dall’Istituto di Bioscienze e BioRisorse del CRN di Bari, è suddiviso in quattro regioni: due a singola copia, una grande (LSC) e una piccola (SSC), separate da due regioni ripetute e invertite (IR). Ha una lunghezza di 152.529 nucleotidi e contiene 131 geni. Oltre a quello del Carciofo brindisino, è stato sequenziato anche il genoma cloroplastico di altri 21 genotipi appartenenti ad altre varietà di carciofo, cardo coltivato e a tipi selvatici. Il confronto di questi genomi ha consentito di individuare una serie di marcatori molecolari per Cynara. In totale sono stati identificati 384 caratteri variabili e 39 marcatori “microsatelliti” utili per definire la variabilità genetica nel genere Cynara e nella specie Cynara cardunculus.
Informazioni dettagliate possono essere recuperate nella pubblicazione:
Curci P.L., De Paola D., Sonnante G., (2015). Development of chloroplast genomic resources for Cynara. Mol Ecol Resour. DOI: 10.1111/1755-0998.12457
